肌痛综合症可以是全身性病变（有时继发于其他病变），也可以是局限性的（如肌筋膜痛综合征常与劳损或轻微外伤有关）。原发性肌痛综合征（PFS）是全身性特发性疾病，特别多见于健康的年轻和中年女性，具有紧张，抑郁，忧虑和努力奋斗型的倾向，但也可发生在儿童（尤其是女孩）或老年人，常伴轻微的椎骨骨关节炎的改变。男性尤其容易发生特殊的职业性或娱乐性肌肉劳损所致的局限性肌痛。少数病例可能与心理和生理学异常有关。由于周围环境和精神上的压力，或者由于医生不能很好地解除患者的忧虑，而只简单地斥之为“全是你的头脑作祟”等等，均能使症状加重。
轻症肌痛可随着紧张的解除而自行消退，但常可能出现反复或转为慢性。使病人放心和说明本病为良性疾病，伸展练习，有氧健身，改善睡眠，局部热敷，轻柔按摩均能使病情减轻。睡前服用小剂量三环类抗抑郁药（如阿米替林10mg或最小有效耐受剂量）能加深睡眠并对疼痛有调节作用。阿司匹林650mg每3~4小时1次，或足够剂量的其他非类固醇抗炎药在临床试验中显示无效，但可能对某些人有帮助。可在压痛，无力的局部单纯注射1%利多卡因1ml或2ml,或与20~40mg醋酸氢化可的松混悬液一起注射（方法见慢性下背痛治疗中的软组织注射）。若某药物出现嗜睡作用，则可改用其他同类药（小剂量）。早晨服用5-羟色胺特异性抑制剂（如氟苯哌苯醚HCl10mg或20mg）能减轻抑郁，改善症状。必须小心避免因用药加重睡眠问题，否则会引起失眠。并用综合性支持疗法者功能性预后良好，虽然程度不同的症状可持续存在。针对焦虑或抑郁的治疗，则需要更积极的特殊方法和病人的配合支持。总之，最佳治疗应该是个体化，综合性且可调整，并要求病人直接参与。
